Setelah itu, perlawanan dilanjutkan oleh Sultan Alaudin Riayat Syah al-Qahar dengan meminta bantuan Turki.
Dapat diduga bahwa keputusan Raja Muda yang membebaskan Don Manuel Tabariji dari tuduhan Tristiao de Ataide, tidak terlepas dari hibah wasiatnya yang menyerahkan Ambon dan sekitarnya kepada Jordao de Freitas, dan pernyataannya akan menjadikan sebagai sebuah kerajaan Kristen yang tunduk pada Kerajaan Portugal.
Karena produsen sudah dikuasai VOC, maka pada saat rempah — rempah dijual, harganya sangat turun.
Armada ini tiba di Ternate pada 13 Mei 1607.